独特的乙型肝炎病毒subgenotype在一个原始部落社区在印度东部。
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Banerjee Ghosh S, P, RoyChoudhury Sarkar年代,Ghosh, Santra, Banerjee年代,Das K, Dwibedi B,冰斗SK,饶VG, Bhat JT,辛格N, Chowdhury,达塔
独特的乙型肝炎病毒subgenotype在一个原始部落社区在印度东部。
中国Microbiol。2010年11月,48 (11):4063 - 71。doi: 10.1128 / JCM.01174-10。Epub 2010年9月15日。
- PubMed ID
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20844228 (在PubMed]
- 文摘
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乙型肝炎病毒(HBV)菌株与原始印度东部Paharia民族共同体的成员进行了研究,了解病毒的遗传多样性与进化。Paharia部落仍相当独立于其他印度人,文化不同,基因,和语言的主流东印度人口,乙肝病毒株的以前的特点。完整的乙肝病毒DNA PCR扩增、克隆和测序。部落之间的系统发育关系序列和参考序列与主流人口进行评估,和分歧时间的subgenotypes HBV基因型D估计。乙肝病毒被发现在2%的paharia参与这项研究。乙型肝炎的优势前paharia观察感染(73%),和乙肝病毒株的基因组序列表现出相对同质性、突变的发病率很低。Paharia HBV的小说特征是独家D5 subgenotype面前,这是最近在印度东部了。分析的四个开放阅读框(orf),这些部落HBV D5序列和比较与之前报道D1 D7序列使27的识别特定的氨基酸残基,包括6个独特的,可以被认为是D5签名。之间的分歧时间估计subgenotypes D1 D5表明D5是第一个有分歧,因此是最古老的D subgenotypes。特定的存在,古代subgenotype乙肝病毒在一个民族的原始,同族结婚的人口突出研究乙肝病毒遗传学的重要性在布置得井然有序人类理解社区和基因组进化之间的病毒传播。