基因组序列的一个工业微生物链霉菌属avermitilis:推导出生产次生代谢产物的能力。
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Omura年代,Ikeda H,石川J, Hanamoto,高桥C, Shinose M,高桥Y, Horikawa H, Nakazawa H, Osonoe T,菊池H,日本柴T,淡比Y,服部年宏M
基因组序列的一个工业微生物链霉菌属avermitilis:推导出生产次生代谢产物的能力。
《美国国家科学院刊S a . 2001年10月9日,98 (21):12215 - 20。Epub 2001年9月25日。
- PubMed ID
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11572948 (在PubMed]
- 文摘
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链霉菌属avermitilis不仅是一种土壤细菌,执行一个复杂的形态分化,还生产次生代谢产物,其中,avermectin,商业上重要的人类和兽医。这个属链霉菌属的主要兴趣是生产次生代谢产物的多样性作为一个工业微生物。其突出的主要因素作为生产者的各种次生代谢物是它拥有几个生物合成的代谢途径。在这里,我们报告美国avermitilis序列分析,覆盖99%的基因组。至少870万个碱基对中存在线性染色体;这是最大的细菌基因组序列,它提供了洞察内在多样性的生产次生代谢产物的链霉菌属。25种次生代谢基因簇是美国avermitilis的基因组中发现的。四人关心从花色黑色素的色素,在两个集群编码酪氨酸酶及其代数余子式,另一个两个编码黄褐病颜料来自homogentiginic酸,和另一个polyketide-derived黑色素。类胡萝卜素的基因簇,含铁细胞从花色由七和五个基因,分别。有八种基因集群i型酮化合物复合从花色,从花色和两个集群的ⅱ型polyketide-derived化合物。 Furthermore, a polyketide synthase that resembles phloroglucinol synthase was detected. Eight clusters are involved in the biosyntheses of peptide compounds that are synthesized by nonribosomal peptide synthetases. These secondary metabolite clusters are widely located in the genome but half of them are near both ends of the genome. The total length of these clusters occupies about 6.4% of the genome.