完整的基因组序列和比较分析工业微生物的链霉菌属avermitilis。
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Ikeda H,石川J, Hanamoto Shinose M,菊池H,日本柴T,淡比Y,服部年宏M, Omura年代
完整的基因组序列和比较分析工业微生物的链霉菌属avermitilis。
生物科技Nat》。2003; 21(5): 526 - 31所示。Epub 2003年4月14。
- PubMed ID
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12692562 (在PubMed]
- 文摘
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属的物种链霉菌属大型制药的兴趣,因为它们合成多种具有生物活性的次生代谢产物。我们已经确定完整的核苷酸序列的线性染色体的链霉菌属avermitilis。美国avermitilis产生avermectins,一群杀寄生虫药制剂用于人类和兽医。基因组中包含9025608个碱基(平均GC含量70.7%)和编码至少7574潜在的开放阅读框(orf)。百分之三十五的orf(2664)构成721 paralogous家庭。三十次生代谢产物生物合成相关的基因簇,对应于基因组的6.6%。与链霉菌属coelicolor A3(2)显示,美国内部6.5 mb地区avermitilis基因组高度保守的基因顺序和内容,和包含所有已知基本基因但oriC中心显示完全不对称结构。相比之下,终端区域并不守恒和优先包含不必要的基因。