完整的单元覆盖液相色谱电喷雾电离质谱(LCMS +)的低聚物的膜蛋白:细胞色素b (6) f复杂从菠菜和藻青菌Mastigocladus laminosus。
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泰勒Whitelegge JP,张H,阿奎莱拉R, RM,克莱默佤邦
完整的单元覆盖液相色谱电喷雾电离质谱(LCMS +)的低聚物的膜蛋白:细胞色素b (6) f复杂从菠菜和藻青菌Mastigocladus laminosus。
摩尔细胞蛋白质组学。2002年10月,1(10):816 - 27所示。
- PubMed ID
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12438564 (在PubMed]
- 文摘
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高度活跃的细胞色素b (6) f复合物从菠菜和藻青菌Mastigocladus laminosus已经分析了液相色谱与电喷雾质谱(LCMS +)。凝胶排阻和反相分离是用于分离蛋白质亚基允许它们的分子质量测量精度超过0.01% (+ / 3 30000 Da Da)。善待动物组织的产品,petB、petC petD, petG, petL,古,和以季戊四醇四硝酸酯复合物中发现从菠菜和m . laminosus而菠菜复杂也包含ferredoxin-NADP(+)氧化还原酶(张,H。、Whitelegge j . P。克莱默,w . a (2001) Flavonucleotide:铁氧还蛋白还原酶的亚基植物细胞色素b (6) f复杂。生物。276年化学,38159 - 38165)。虽然PetC的测量质量和PetD(分别为18935.8和17311.8 Da)从菠菜符合公布的一级结构,测量大量的细胞色素f (31934.7 Da,善待动物组织)和细胞色素b (24886.9 Da, PetB)适当偏离值计算基于基因组序列和已知的转录后修饰。低分子量蛋白质亚基已经使用串联质谱测序(msm)事先乳沟。序列来自这些完整的膜蛋白的msm光谱范围3.2 - -4.2 kDa的翻译比较基因组DNA序列。产品的菠菜叶绿体基因组、PetG、PetL,以季戊四醇四硝酸酯,保留他们的初始formylmethionine,而核编码的古从细胞质中导入后裂解。 While the sequences of PetG and PetN revealed no discrepancy with translations of the spinach chloroplast genome, Phe was detected at position 2 of PetL. The spinach chloroplast genome reports a codon for Ser at position 2 implying the presence of a DNA sequencing error or a previously undiscovered RNA editing event. Clearly, complete annotation of genomic data requires detailed expression measurements of primary structure by mass spectrometry. Full subunit coverage of an oligomeric intrinsic membrane protein complex by LCMS+ presents a new facet to intact mass proteomics.