x射线晶体分析抑制剂和底物复合物的野生型和突变体4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase。
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霍顿Thoden JB,嗯,壮族Z, Dunaway-Mariano D
x射线晶体分析抑制剂和底物复合物的野生型和突变体4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase。
J生物化学杂志。2002年7月26日,277 (30):27468 - 76。2002年5月7日Epub。
- PubMed ID
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11997398 (在PubMed]
- 文摘
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4-chlorobenzoate的代谢途径是4-hydroxybenzoate退化土壤中微生物的假单胞菌sp.应变CBS-3包括三个酶包括4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase。释放的结构形式的这种thioesterase包含所谓的“热狗”褶皱大螺旋包装five-stranded反平行β褶板。解决的方式活性部位中的酶提供衬底,两种抑制剂已被合成,即4-hydroxyphenacyl-CoA和4-hydroxybenzyl-CoA。这里我们描述这两个酶的结构分析与抑制剂确定和细化,以1.5和1.8的决议。这些研究表明,只有一个蛋白质侧链,爵士(91),直接参与配位体绑定。所有其他的蛋白质之间的相互作用和抑制剂通过骨干peptidic NH组、羰基氧和/或溶剂。酶抑制剂复合物的结构表明,氢键和积极的螺旋的偶极矩为极化电子远离的羰基碳酰基组,从而使其更容易受到亲核攻击。此外,这些研究表明,羧基的Asp(17)大约是3.2的羰基碳酰基组。为了解决Asp(17)的作用,基因定点突变蛋白的结构与绑定D17N衬底也已确定。综上所述,这些调查表明,反应机制可能通过一个酰基酶中间进行。