晶体结构的aclacinomycin methylesterase绑定产品的类似物:对蒽环霉素识别和机制的影响。
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简颂,尼米J, Mantsala P,施耐德G
晶体结构的aclacinomycin methylesterase绑定产品的类似物:对蒽环霉素识别和机制的影响。
J生物化学杂志。2003年10月3;278(40):39006 - 13所示。Epub 2003年7月23日。
- PubMed ID
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12878604 (在PubMed]
- 文摘
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Aclacinomycin methylesterase (RdmC)是一个裁缝修改aklavinone骨架的酶生物合成的蒽环霉素链霉菌属的物种。这种酶的晶体结构链霉菌属purpurascens在复杂产品的类似物10-decarboxymethylaclacinomycin T和10-decarboxymethylaclacinomycin决心名义决议1.45和1.95,分别。RdmC建立两个领域。更大的α/β领域显示了常见α/β水解酶折叠,而较小的域是α螺旋。活性部位和底物结合口袋是位于两个域之间的接口。Decarboxymethylaclacinomycin T和Decarboxymethylaclacinomycin绑定接近催化三分子(Ser102-His276-Asp248)疏水口袋里的糖半个位于酶的表面。绑定的配体是由疏水相互作用,和特异性似乎控制主要是通过结合口袋的形状而不是通过特定的氢键。机械的关键特性符合复合物的结构与产品类似Ser102 RdmC作为亲核试剂和过渡态稳定的oxyanion洞形成的骨干酰胺残留Gly32 Met103。