特异性的ModA11 ModA12 ModD1表观遗传调节N(6)腺嘌呤DNA甲基转移酶的脑膜炎奈瑟菌。
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特异性的ModA11 ModA12 ModD1表观遗传调节N(6)腺嘌呤DNA甲基转移酶的脑膜炎奈瑟菌。
核酸研究》2015年4月30日,43 (8):4150 - 62。doi: 10.1093 / nar / gkv219。Epub 2015年4月6日。
- PubMed ID
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25845594 (在PubMed]
- 文摘
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相变异(随机开/关开关)的基因表达是一种常见的特征host-adapted致病性细菌。阶段不定地表示N(6)腺嘌呤DNA甲基转移酶(Mod)改变全球甲基化模式导致基因表达的变化。这些系统构成阶段变量称为phasevarions调节子。脑膜炎奈瑟菌phasevarions调节基因包括毒性因素以及候选疫苗,并改变表型包括抗生素耐药性。目标站点认可这些类型III N(6)腺嘌呤DNA甲基转移酶是未知的。单分子实时(SMRT) methylome分析用来确定脑膜炎奈瑟菌识别网站三个关键甲基转移酶:ModA11 (M.NmeMC58I为例)(5‘-CGY M6A:三大”),ModA12(以M。Nme77I, M。Nme18I和M.Nme579II) (5 ' - ac M6A: CC-3 ')和ModD1 (M.Nme579I为例)(5 ' cc M6A: GC-3”)。限制抑制化验和诱变证实了SMRT methylome分析。ModA11站点是复杂的和非典型和依赖于类型的嘧啶在中央位置,结合基地侧翼的核心识别序列5”-CGY M6A:三大”。观察效率modA11应变(MC58)基因组甲基化的范围从4.6% 5的-GCGC M6A: GG-3”网站,100%在5”-ACGT M6A: GG-3”网站。 Analysis of the distribution of modified sites in the respective genomes shows many cases of association with intergenic regions of genes with altered expression due to phasevarion switching.