阻遏物的基因研究。十四。4000改变了大肠杆菌lac阻遏蛋白的分析,将揭示基本和不必要的残留物,以及“太空人”,不需要特定的序列。
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Markiewicz P, Kleina LG,克鲁兹C, Ehret年代,米勒JH
阻遏物的基因研究。十四。4000改变了大肠杆菌lac阻遏蛋白的分析,将揭示基本和不必要的残留物,以及“太空人”,不需要特定的序列。
J杂志。1994年7月29日,240(5):421 - 33所示。
- PubMed ID
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8046748 (在PubMed]
- 文摘
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琥珀突变一直在建造328个职位,对应于大肠杆菌阻遏物残留2到329的蛋白质。合成和天然胡说抑制用于插入、串联,12 - 13氨基酸在指定位置的琥珀lacI mRNA (UAG)密码子。结果集超过4000个氨基酸替换的阻遏物蛋白质允许一个详细的分析其替换沿着残留的线性阵列,宽容和揭示了结构的关系在阻遏物和蛋白质。(1)有两个主要地区的抑制因子对氨基酸置换非常敏感。,伴59残留,与DNA和运营商绑定了大量的工作。第二,从大约残留239 - 289/292,形成抑制因子最核心和股票与其他阻遏和DNA结合蛋白质同源性。(2)在剩余的蛋白质,6到14段氨基酸,这是非常宽容的单一的氨基酸替换,似乎成为“太空人”的一个或多个疏水残基之间相对宽容替换。(3)我们已经取代了氨基酸在这些宽容地区丙氨酸残基的跨越,从5到13个氨基酸。在所有5个区域的测试,丙氨酸替代,有时高达8个氨基酸,仍然允许功能抑制因子,同时删除相同的残留摧毁阻遏作用。这加强了蛋白质的观点,许多地区不需要一个特定的序列作为间隔器之间残留更重要。 (4) A distinct pattern of substitutions leading to the I(s) phenotype suggests the location of residues involved in inducer binding. (5) A number of general substitution patterns can be recognized. For instance, proline is not tolerated at over 40 sites which tolerate all the other amino acid replacements. Another set of sites tolerates only non-polar amino acids, whereas a third set tolerates a subset of the smallest amino acids, (serine, alanine, glycine and cysteine, and sometimes threonine and valine). (5) Overall, 93 of 328 sites (28%) tolerate all 13 amino acids tested, and 144 of 328 (44%) tolerate 12/13 or all 13 substitutions. We judge that 192 of 328 sites (59%) are generally tolerant to substitutions.