精制阻遏物结构盔(1-56)由放松从2 d和3 d矩阵计算一个数据:三级结构的变化对lac运营商绑定。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Slijper M, Bonvin, Boelens R, Kaptein R
精制阻遏物结构盔(1-56)由放松从2 d和3 d矩阵计算一个数据:三级结构的变化对lac运营商绑定。
J杂志。1996年6月21日,259 (4):761 - 73。
- PubMed ID
-
8683581 (在PubMed]
- 文摘
-
解决方案的DNA结合结构域的阻遏物(盔1-56;HP56)精制利用2 d和3 d NMR光谱数据。结构来源于1546年限制(残给平均27.6),包括389 intraresidual 402顺序,385中程和325远程距离限制也30φ15气1二面角限制。结构由直接优化的方法对核奥佛好塞增强峰值卷程序恐龙。最后一组32所选结构显示一个r.m.s.偏离平均为0.43(+ / - -0.08)埃(骨干)和0.95(+ / - -0.08)埃(所有重原子)最好的定义区域的蛋白质(残留3 - 49)。合奏r因子为0.35,这表明关闭通信与实验数据。结构显示良好的立体化学的品质。NMR结构的构象的自由和DNA阻遏物帽子比较。组成二级结构元素的区域显示构象密切对应。然而,螺旋之间循环的构象II和III变化显著的络合盔。 This change in the conformation of the loop in lac HP56 is essential for binding of the side-chains of residues Asn25 and His29 to the lac operator DNA. Finally, the lac headpiece residues that are intolerant to mutations were analysed. Most of these mutation-sensitive residues are important for a correct folding of the headpiece region, and a number of these residues are also involved in contacting the operator DNA.