的完整基因组序列Moorella thermoacetica thermoaceticum梭状芽胞杆菌(f)。
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谢皮尔斯E, G, Barabote RD,桑德斯E,韩寒CS,德JC,理查森P, Brettin TS, Das, Ljungdahl LG、Ragsdale西南
的完整基因组序列Moorella thermoacetica thermoaceticum梭状芽胞杆菌(f)。
环境Microbiol。2008年10月,10 (10):2550 - 73。doi: 10.1111 / j.1462-2920.2008.01679.x。Epub 2008 6月9。
- PubMed ID
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18631365 (在PubMed]
- 文摘
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介绍了基因组序列的Moorella thermoacetica (f thermoaceticum梭状芽胞杆菌),即模型乙酸细菌已被广泛用于阐明Wood-Ljungdahl途径有限公司和股份有限公司(2)固定。这个途径,这也被称为还原乙酰辅酶a通路,使乙酸(通常称为homoacetogenic)细菌化学计量的葡萄糖转化为乙酸3摩尔和成长autotrophically使用H(2)和有限公司作为电子给体和(2)作为电子受体。产甲烷古菌利用这个途径反过来增加乙酸转化为甲烷和(2)。乙酸细菌还几个Wood-Ljungdahl途径代谢的其他各种途径,允许多种碳源和电子给体(糖、羧酸、醇类和芳香族化合物)和电子受体(硝酸盐、亚硝酸盐有限公司(2),硫代硫酸盐,二甲亚砜和芳香羧基组)。基因组包含一个圆形2 628 784 bp的染色体编码2615开放阅读框(orf),其中包括2523年预测蛋白质编码的基因。其中1834个基因(70.13%)被分配初步功能,665(25.43%)匹配未知功能的基因,和其余24(0.92%)没有数据库匹配。总共有2384(91.17%)的orf m . thermoacetica基因组可分为orthologue集群。第一个基因组序列的乙酸细菌提供了重要的信息关系到产乙酸菌如何参与他们的极端代谢多样性之间通过切换不同的碳基板和电子给体/受体以及他们如何节约能源,无氧呼吸。我们的基因组分析表明,homoacetogenesis是核心的关键遗传特质acs Wood-Ljungdahl通路的基因簇。