3-methyladenine DNA糖基化酶的晶体结构MagIII和识别烷基化基地。
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Eichman BF, O’rourke EJ, T, Radicella JP -艾伦伯格
3-methyladenine DNA糖基化酶的晶体结构MagIII和识别烷基化基地。
EMBO j . 2003年10月1日,22日(19):4898 - 909。
- PubMed ID
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14517230 (在PubMed]
- 文摘
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DNA糖基化酶催化化学改性基地从DNA的切除。尽管大多数糖基化酶是特定于一个特定的基地,在3-methyladenine (m3A) DNA糖基化酶包括高度特定的酶作用于单个修改基地,与更广泛的特异性和酶alkylation-damaged DNA。结构理解这些不同的酶特异性目前限于unliganded酶的晶体和NMR结构与基本DNA抑制剂复合物。这里介绍的高分辨率的晶体结构m3A从幽门螺杆菌DNA糖基化酶(MagIII) unliganded形式和烷基化基地3,N6-ethenoadenine 9-dimethyladenine和1。这是第一个结构nucleobase绑定的活性部位m3A糖基化酶属于helix-hairpin-helix总科。MagIII达到其特异性带正电荷m3A不是通过直接与嘌呤的交互或甲基取代基原子,而是由叠加两个芳香族侧链之间的基地在口袋里,不包括7-methylguanine。我们报告基本切除和DNA结合活动MagIII活性位点突变体,连同一个结构比较终极战士的糖基化酶。