的完整基因组序列alkaliphilic halodurans芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌基因组序列的比较。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
高木K Takami H,那段时间,Y, Maeno G,佐佐木R, Masui N,富士F, Hirama C,中村Y,小笠原群岛N, Kuhara年代,Horikoshi K
的完整基因组序列alkaliphilic halodurans芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌基因组序列的比较。
核酸研究》2000年11月1日,28(21):4317 - 31所示。
- PubMed ID
-
11058132 (在PubMed]
- 文摘
-
4 202 353 bp的基因组alkaliphilic细菌芽孢杆菌halodurans c - 125包含4066预测蛋白质编码序列(CDSs), 2141(52.7%)的功能任务,1182(29%)是守恒的信用违约掉期的未知函数和743 (18。3%)没有匹配任何蛋白质数据库。在总信用违约掉期,8.8%匹配序列的蛋白质发现只有在枯草芽孢杆菌和66.7%广泛守恒与各种生物的蛋白质相比,包括B.subtilis。b . halodurans基因组含有112转座酶基因,表明转座酶发挥了重要的进化作用在水平基因转移和内部遗传基因组重排。菌株c - 125缺少一些必要的能力的基因,如铺盖,srfA rapC,支持这一事实能力没有演示实验在c - 125。teichuronopeptide tupA没有假字,编码,导致alkaliphily,在c - 125基因组中并直接同源tupA中不能找到B。细小的基因组。11的σ因子属于extracytoplasmic功能的家庭,10 b . halodurans是独一无二的,这表明他们可能有一个角色的特殊机制适应一个碱性环境。