谷氨酰胺的晶体结构:phenylpyruvate转氨酶从栖热菌属酸奶HB8:诱导契合和底物识别。
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Goto M, Omi R, Miyahara我,细野豪志,Mizuguchi H, Hayashi H, H Kagamiyama Hirotsu K
谷氨酰胺的晶体结构:phenylpyruvate转氨酶从栖热菌属酸奶HB8:诱导契合和底物识别。
生物化学杂志。2004年4月16日;279(16):16518 - 25所示。Epub 2004年2月3。
- PubMed ID
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14761974 (在PubMed]
- 文摘
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谷氨酰胺的三维结构的三种形式:phenylpyruvate转氨酶从栖热菌属酸奶HB8已经决定,代表第一个酶的x射线分析:该unliganded吡哆醛5 '磷酸形成1.9决议和两个复合物3-phenylpropionate和alpha-keto-gamma-methylthiobutyrate分辨率2.35和2.6,分别。酶显示高活动对苯丙氨酸,酪氨酸、色氨酸,犬尿氨酸、甲硫氨酸和谷氨酰胺。为酶体,每个单元分为一个氨基的胳膊,小型和大型域。基于其折叠酶属于I型折叠,转氨酶Ib子类,子类我转氨酶的结构到目前为止确定展览大运动的小域地区在衬底的绑定。同样,谷氨酰胺:phenylpyruvate转氨酶经历一个大运动的一部分小域关闭活性部位。活性位点的口袋里有一个形状和大小适合附上芳香族氨基酸的侧链或蛋氨酸。内口袋里主要是疏水的,但也有极网站。犬尿氨酸复杂的由计算机模拟生成符合酶及其亲水性基团的口袋与极性交互网站的口袋里。