工业中的地衣芽孢杆菌的完整基因组序列和比较与芽孢杆菌物种密切相关。
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雷伊兆瓦,Ramaiya P,纳尔逊英航,Brody-Karpin SD, Zaretsky EJ,唐米,洛佩兹德莱昂,湘H, Gusti V,克劳森搞笑,奥尔森PB,拉斯穆森医学博士,安徒生JT,约根森PL,拉森TS, Sorokin, Bolotin,拉皮德斯,Galleron N,埃利希SD,贝尔卡RM
工业中的地衣芽孢杆菌的完整基因组序列和比较与芽孢杆菌物种密切相关。
基因组医学杂志。2004;5 (10):R77。Epub 2004年9月13日。
- PubMed ID
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15461803 (在PubMed]
- 文摘
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背景:地衣芽孢杆菌是一种革兰氏阳性,孢子形成的土壤细菌,用于生物技术产业制造酶、抗生素、生化药品和消费品。这个物种密切相关微生物枯草芽孢杆菌的研究模型,并生成各种各样的胞外酶,可能导致养分循环。结果:我们确定完整的写明ATCC 14580 b .地衣芽基因组核苷酸序列组成一个圆形染色体4222336碱基对(bp)包含4208预测蛋白质编码基因平均大小为873个基点,七rRNA操纵子,72 tRNA基因。地衣芽b染色体包含大型区域共线的枯草芽孢杆菌和芽孢杆菌的基因组halodurans,地衣芽和大约80%的预测编码序列有枯草芽孢杆菌直接同源。结论:尽管明显组织相似性b .地衣芽和枯草芽孢杆菌基因组,存在显著差异在噬菌体原的数量和位置,转座的元素和大量的胞外酶和次生代谢途径区分这些物种的操纵子。包括地区超过80个碱基差异(kb),由一群酮化合物合酶基因和第二个操纵子的38个kb编码plipastatin合成酶的酶在b .地衣芽基因组中缺席。完成基因组序列的可用性为地衣芽b应该促进设计与施工的改进工业菌株和允许比较基因组学和进化研究在这个群芽胞杆菌科。