高亲和力的铜绿假单胞菌海藻糖结合凝集素PA-IIL: 1.0分辨率晶体结构的复杂结合热力学和计算化学方法。
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米切尔EP,萨宾C, Snajdrova L, Pokorna M, Perret年代,Gautier C, Hofr C, Gilboa-Garber N, Koca J, Wimmerova M, Imberty
高亲和力的铜绿假单胞菌海藻糖结合凝集素PA-IIL: 1.0分辨率晶体结构的复杂结合热力学和计算化学方法。
蛋白质。2005年2月15日,58 (3):735 - 46。
- PubMed ID
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15573375 (在PubMed]
- 文摘
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PA-IIL fucose-binding凝集素从铜绿假单胞菌,细菌的毒力因素密切相关。以前的结构研究揭示了一个新的carbohydrate-binding模式直接参与两个钙离子(米切尔E, Houles C, Sudakevitz D, Wimmerova M, Gautier C,佩雷斯年代,吴,Gilboa-Garber N, Imberty a结构依据选择性识别低聚糖的囊性纤维化患者铜绿假单胞菌的凝集素PA-IIL。Nat结构生物学观点》9:918 2002;921)。结合热力学、结构和计算方法已被用于研究单糖的高亲和力配体的基础。滴定微量热法研究表明,高亲和力是焓驱动的。在复杂的晶体结构四聚物的PA-IIL岩藻糖和钙1.0决议和提炼,结合建模,允许一个提议的网络形成氢键结合位点。使用从头开始计算化学方法计算部分指控表明,广泛的钙离子之间的电荷离域,此种网站和碳水化合物的侧链配体负责的高焓绑定,因此观察到的异常高亲和力这个独特的碳水化合物的识别模式。