工程PA-IIL凝集素从铜绿假单胞菌-解体的作用特异性循环对糖的偏好。
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亚当•J Pokorna M,萨宾C,米切尔EP, Imberty, Wimmerova M
工程PA-IIL凝集素从铜绿假单胞菌-解体的作用特异性循环对糖的偏好。
BMC结构生物学观点》2007年6月1;36。
- PubMed ID
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17540045 (在PubMed]
- 文摘
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背景:凝集素非免疫来源的蛋白质能够绑定糖类结构具有高特异性和亲和力。考虑到高编码能力的低聚糖,这使得凝集素粘附和认可。本研究致力于从铜绿假单胞菌PA-IIL凝集素,一种投机取巧的人类病原体能够导致囊性纤维化患者致命的并发症。凝集素可能发挥重要作用的过程中毒性,识别特定的糖类结构,随后让细菌坚持宿主细胞。它显示高值对单糖的亲和力,尤其是海藻糖——一个特性引起的不寻常的绑定模式,两个钙离子参与与糖类的交互。调查和理解的本质lectin-saccharide互动拥有巨大潜力的药物设计领域的使用,即活性化合物的目标和交付正确的行动。结果:PA-IIL凝集素的体外定点诱变产生了三个单点突变体进行了结构(通过x射线晶体学)和功能(通过等温滴定量热法)。突变氨基酸(22-23-24三)属于所谓的特异性结合循环负责的单糖特异性凝集素。氨基酸的突变导致变化的热力学行为突变体对单糖和随后的相对偏好。相关的测量数据与x射线结构合理化亲和力的变化提供分子依据。 The mutations either prevent certain interactions to be formed or allow formation of new interactions--both of afore mentioned have strong effects on the saccharide preferences. CONCLUSION: Mutagenesis of amino acids forming the specificity binding loop allowed identification of one amino acid that is crucial for definition of the lectin sugar preference. Altering specificity loop amino acids causes changes in saccharide-binding preferences of lectins derived from PA-IIL, via creation or blocking possible binding interactions. This finding opens a gate towards protein engineering and subsequent protein design to refine the desired binding properties and preferences, an approach that could have strong potential for drug design.