家庭10个糖苷水解酶的机制结合底物装饰。
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佩尔G,泰勒EJ、釉TM Turkenburg JP,丰特斯厘米,费雷拉LM,纳吉T,克拉克SJ,戴维斯GJ,吉尔伯特HJ
家庭10个糖苷水解酶的机制结合底物装饰。
J生物化学杂志。2004年3月5日,279 (10):9597 - 605。Epub 2003 12月10。
- PubMed ID
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14668328 (在PubMed]
- 文摘
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Endo-beta-1 4-xylanases(木聚糖酶),打通beta 1,木聚糖骨干4糖苷键,曲目的酶的重要组成部分,促进植物细胞壁降解。的机制这些酶能够水解各种装饰木聚糖仍不清楚。这里显示的三维结构,由x射线晶体学,和催化性能的Cellvibrio mixtus酶Xyn10B (CmXyn10B),最活跃的GH10木聚糖酶的描述。酶的晶体结构在复杂xylopentaose显示在+ 1子木糖一半是夹在疏水残基之间,比在其他可能调解紧绑定GH10木聚糖酶。木聚糖酶的晶体结构在复杂的装饰xylooligosaccharides揭示了这种酶能够水解木聚糖代替。溶剂接触的0 2 + 4组木糖,+ 3,+ 1,和3子可能允许住宿的alpha - 2-linked 4-O-methyl-d-glucuronic酸侧链在glucuronoxylan这些位置。此外,糖醛酸使氢键和疏水相互作用的酶+ 1子,表明糖装饰glucuronoxylan针对这近端糖苷配基结合位点。住宿3的链接l-arabinofuranoside装饰2子,可以观察到,最有可能的是,被容忍当绑定到木糖苷在3 + 4。绑定模式的一个显著特点布置基质子站的特异性都量身定做,以防止“终端”反应产品的形成和促进协同木聚糖酶degradation-accessory alpha-glucuronidase等。在这个报告中描述的数据和在同期发表的一篇论文表明,绑定的互补性装饰基质glycone和糖苷配基之间的地区似乎是守恒的特性GH10木聚糖酶。