ammonia-oxidizing细菌的完整基因组序列和预留chemolithoautotroph硝化菌。
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链P, Lamerdin J,此外F, Regala W,老挝V,土地M,豪泽L, Hooper,克洛茨M,诺顿J, Sayavedra-Soto L, Arciero D, Hommes N,惠塔克米,Arp D
ammonia-oxidizing细菌的完整基因组序列和预留chemolithoautotroph硝化菌。
J Bacteriol。2003年5月,185 (9):2759 - 73。
- PubMed ID
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12700255 (在PubMed]
- 文摘
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硝化菌(写明ATCC 19718)是一种革兰氏阴性专chemolithoautotroph,可以推出它所有的能量和还原剂氨氧化为亚硝酸盐的增长。N欧洲亚硝化单胞菌参与生物地球化学循环过程中硝化作用。其基因组由一个环形染色体的2812094个基点。GC斜分析表明基因组分为两个不平等的replichores。基因在基因组中分布均匀,从一个链大约47%转录和转录大约53%的互补链。共有2460个蛋白质编码基因出现在建模工作,平均1011个基点的长度,平均基因间区域为117个基点。基因所必需的氨的分解代谢,能量和还原剂的一代,生物合成,CO(2)和NH(3)同化被确定。相比之下,有机化合物的分解代谢的基因是有限的。基因编码了无机离子转运蛋白丰富,而有机分子的转运蛋白基因编码不足。复杂重复的元素构成,5%的基因组。 Among these are 85 predicted insertion sequence elements in eight different families. The strategy of N. europaea to accumulate Fe from the environment involves several classes of Fe receptors with more than 20 genes devoted to these receptors. However, genes for the synthesis of only one siderophore, citrate, were identified in the genome. This genome has provided new insights into the growth and metabolism of ammonia-oxidizing bacteria.