substrate-free MurB形式的结构,一个细菌细胞壁的合成的关键酶。
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本森TE,沃尔什CT, Hogle JM
substrate-free MurB形式的结构,一个细菌细胞壁的合成的关键酶。
结构。1996年1月15;4 (1):47-54。
- PubMed ID
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8805513 (在PubMed]
- 文摘
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背景:重复二糖和五肽单位细菌肽聚糖层的连接由一个lactyl醚桥biosynthesized UDP-N-acetylglucosamine和磷酸烯醇丙酮酸顺序烯醇催化醚转移和减少步骤分别通过色差和MurB。知识的结构和机制MurB酶将允许分析这种不同寻常的烯醇酯还原反应,并可能促进抑制剂的设计新一代抗菌药物作为候选人。结果:UDP-N-acetylenolpyruvylglucosamine还原酶的晶体结构,在3.0 MurB,已经解决了,而我们之前报道的结构MurB包裹着它的衬底enolpyruvyl-UDP-N -乙酰氨基葡萄糖。比较这个unliganded MurB的配体结构形式显示,底物诱发大量运动的绑定域3(酶的残留,219 - 319年)和一个循环的一个重要重排在这个领域。这些配体诱导的变化扰乱堆积相互作用两个酪氨酸(Tyr190和Tyr254)躺在一边的通道通往自由酶的活性部位。结论:enolpyruvyl-UDP-N -乙酰氨基葡萄糖引起的构象改变绑定MurB结果在关闭substrate-binding通道衬底。Tyr190波动在通道开放和建立一个氢键的氧糖核苷酸衬底的alpha-phosphate衬底绑定是至关重要的。