描述辅酶ii +绑定perdeuterated MurB:骨干原子NMR作业和化学位移的变化。
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君士坦丁KL,穆勒L,戈德法布V, Wittekind M,麦茨勒WJ, Yanchunas J Jr,罗伯逊詹,马利MF,弗里德里希女士,农民BT 2日
描述辅酶ii +绑定perdeuterated MurB:骨干原子NMR作业和化学位移的变化。
J杂志。1997年4月18日,267(5):1223 - 46所示。
- PubMed ID
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9150408 (在PubMed]
- 文摘
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Backbone-atom共振已经分配了substrate-free和辅酶ii +复杂形式的UDP-N-acetylenolpyruvylglucosamine还原酶(MurB) 347 - (38.5 kDa)残留单体的,黄素酶细菌细胞壁生物合成所必需的。统一使用perdeuterated NMR研究进行,13 c / 15 n-labeled MurB样品。对于substrate-free MurB、一个或多个骨干原子已经分配334残留物(96%)。分配的骨干原子包括309 1 hn和15 n原子(94%),315年13 co原子(91%),331年13 c原子(α)(95%),和297年13 c原子(β)(93%)。辅酶ii +多元MurB、一个或多个骨干原子已经分配313残留物(90%);其中包括283个1 hn和15 n原子(86%),305年13 co原子(88%),310年13 c原子(α)(89%),和269年13 c(β)原子(84%)。策略用于获得共振作业详细描述。信息解决方案的二级结构substrate-free和酶的辅酶ii +多元形式一直都是从13 c(α)和13 c(β)无规卷曲偏离化学位移值和从1 hn-1hn不。这些数据相比,x射线晶体结构substrate-free MurB MurB复杂化与UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvate UNAGEP衬底。辅酶ii +绑定诱发显著的化学位移变化残留在已知UNAGEP和时尚结合口袋和地区内发生构象变化在UNAGEP绑定。 The NMR data indicate that NADP+ and UNAGEP utilize the same binding pocket and, furthermore, that the binding of NADP+ induces structural changes in MurB. Finally, many of the residues within the UNAGEP/NADP+ binding pocket were difficult to assign due to dynamic processes which weaken and/or broaden the respective resonances. Overall, our results are consistent with MurB having a flexible active site.