的putidaredoxin reductase-putidaredoxin电子传递复杂:理论和实验研究。
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“库兹涅佐夫”v,布莱尔E,农民PJ, Poulos TL, Pifferitti Sevrioukova如果
的putidaredoxin reductase-putidaredoxin电子传递复杂:理论和实验研究。
生物化学杂志。2005年4月22日;280 (16):16135 - 42。Epub 2005年2月15日。
- PubMed ID
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15716266 (在PubMed]
- 文摘
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之间的交互和电子转移putidaredoxin还原酶(Pdr)和putidaredoxin (Pdx)从假单胞菌putida研究分子建模、诱变,停流技术。基于Pdr的晶体结构和Pdx,一个复杂的蛋白质之间使用计算机图形生成方法。在模型中,Pdx停靠高于异咯嗪环Pdr的时尚之间的距离黄素和14.6 [2 fe-2s]。这种交互方式允许Pdx轻松地调整和优化辅助因子相对于Pdr的取向。的关键残基Pdx位于中心,Asp(38)和Trp(106),在蛋白质界面的边缘,酪氨酸(33)和参数(66),被突变测试Pdr-Pdx计算机模型。Y33A, Y33F D38N、D38A R66A, R66E, W106F, W106A, Delta106突变没有影响装配的[2 fe-2s]集群和导致边际Pdx的氧化还原电位的变化。Delta106 Pdx的传导能力类似于野生型蛋白,而电子转移利率从Pdr其他突变体最大与最小的不同程度,减少影响Pdr-to-Pdx电子转移反应的动力学参数引起的Trp(106)和酪氨酸(33)/ Arg(66)替换,分别。与野生型Pdx相比,所有研究突变体Pdr的亲和力显著更高。实验结果与理论预测一致,表明:(i) Pdr-Pdx复杂的形成主要是由空间互补性,(ii)庞大的侧链的酪氨酸(33),Arg(66),和Trp(106)防止氧化Pdx紧密结合,促进减少iron-sulfur蛋白质Pdr的离解,和(3)转移的一个电子从时尚到[2 fe-2s]与不同取向之间的代数余子式通过多种可能发生电子转移途径不涉及Trp(106),但可能包括Asp(38)和半胱氨酸(39)。