基因组序列分析土壤纤维素分解放射菌类Thermobifida fusca YX。
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Lykidis, Mavromatis K,伊万诺娃N,安德森我土地,DiBartolo G,马丁内斯M,拉皮德斯,卢卡斯,科普兰,理查森P,威尔逊DB, Kyrpides N
基因组序列分析土壤纤维素分解放射菌类Thermobifida fusca YX。
J Bacteriol。2007年3月,189 (6):2477 - 86。2007年1月5 Epub。
- PubMed ID
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17209016 (在PubMed]
- 文摘
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Thermobifida fusca是一种土壤细菌,属于中度嗜热放线菌。是植物细胞壁的主要降能器和已被用来作为生物模型研究分泌,耐热性的多种纤维素酶。完整的基因组序列显示,t . fusca只有一个圆形染色体3642249 bp预测编码3117蛋白质和65种RNA编码密度的85%。基因组分析发现29个假定的糖苷水解酶的存在除了之前发现了多种纤维素酶和木聚糖酶。酶的糖基水解酶包括预测主要展览右旋糖酐/淀粉-和xylan-degrading功能。t . fusca拥有两个蛋白质分泌系统:sec一般分泌系统和twin-arginine易位系统。一些分泌多种纤维素酶的序列特征来显示他们的分泌物可能由twin-arginine易位系统。t . fusca进口的碳水化合物具有广泛的运输系统耦合转录监管机构控制转运蛋白的表达和glycosylhydrolases。除了提供土壤放线菌的生理学的概述,本研究提出了见解的转录调控和分泌多种纤维素酶可以促进工业开发这些系统。