结构的氧化flavodoxin Anacystis nidulans。
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史密斯WW, Pattridge KA,路德维希ML, Petsko GA, Tsernoglou D,田中M, Yasunobu KT次方
结构的氧化flavodoxin Anacystis nidulans。
J杂志。1983年4月25日,165(4):737 - 53年。
- PubMed ID
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6406674 (在PubMed]
- 文摘
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结构的氧化flavodoxin藻青菌Anacystis nidulans已经确定在2.5决议阶段计算从氯化乙基磷酸和dimercuriacetate衍生品。部分序列的测定,包括85残留,协助电子密度的解释。部分的初步细化模型(1072个原子)减少了R为10.997 0.349 2.0和5.0之间的反射与1大于2σ。多肽链包括167残留在当前模型中,采用熟悉beta-alpha-beta构象中发现其他flavodoxins和nucleotide-binding域的pyridine-nucleotide脱氢酶,在中央五个平行链表。比较与flavodoxin议员梭状芽胞杆菌(138残留物)表明,额外的残留的nidulans flavodoxin容纳在一个主要插入长度约20残留,形成一张叶毗邻的第五条平行,在增加一些外部段。beplayapp残留之间添加第四板链和三螺旋的开始改变环境的嘧啶黄素单核苷酸的戒指。黄素单核苷酸的磷酸结合螺旋1的开始,与主链酰胺集团与hydroxyamino酸和交互。两个疏水残基,初步确认Trp,附上异咯嗪环;的solvent-exposed Trp几乎是平行于黄素戒指。这些残留物必须提供的疏水性环境部分负责黄素的分辨率明显振动光谱接近450海里。 The flavin ring is tilted relative to its orientation in Clostridium MP flavodoxin. In addition, atoms N-3 and O-2 alpha of the isoalloxazine appear to form hydrogen bonds to the backbone at CO97 and NH99 in a conformation entirely different from that found in Clostridium MP flavodoxin but structurally analogous to Desulfovibrio vulgaris flavodoxin.