II型的动力学和光谱表征isopentenyl二磷酸异构酶从栖热菌属酸奶:证据的形成substrate-induced黄素的物种。
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Rothman SC,执掌TR,普特CD
II型的动力学和光谱表征isopentenyl二磷酸异构酶从栖热菌属酸奶:证据的形成substrate-induced黄素的物种。
生物化学,2007年5月8日,46 (18):5437 - 45。Epub 2007年4月12日。
- PubMed ID
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17428035 (在PubMed]
- 文摘
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II型isopentenyl二磷酸(IPP)异构酶催化IPP的互变现象和dimethylallyl二磷酸(DMAPP)。尽管II型酶的催化反应和我IPP异构酶的研究类型是相同的,II型蛋白质需要减少黄素活动。的化学机制,包括黄素的作用,尚未建立了II型IPP异构酶。重组II型IPP异构酶从栖热菌属酸奶HB27被Ni2 +亲和色谱法纯化。耗氧纯化酶不活跃,直到黄素代数余子式是降低NADPH或亚硫酸氢或光化学地。不活跃的氧化黄素酶复杂绑定IPP Mg2 +端依赖的方式大概KD KmIPP,表明基质结合蛋白质的不活跃的氧化和活性降低形式与类似的亲和力。N, N-Dimethyl-2-amino-1-ethyl二磷酸(NIPP)、I型的过渡态类似物异构酶,竞争性抑制酶II型,但与更低的亲和力。pH-dependent光谱变化表明,IPP的绑定,DMAPP和饱和模拟异戊基二磷酸促进质子化作用的阴离子减少黄素。电子顺磁共振(EPR)和紫外可见光谱显示substrate-dependent积累的中性黄素黄素酶还原和再氧化过程中半醌IPP的存在和相关的类似物。IPP-bound酶的氧化还原电位表明黄素的中性半醌状态是相对于自由FMN热力学稳定的解决方案。