蛋白质模仿uracil-DNA DNA晶体结构的蛋白质糖基化酶抑制剂及其与大肠杆菌uracil-DNA复杂的糖基化酶。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
普特南CD, Shroyer MJ,伦德奎斯特AJ,摩尔CD, Arvai, Mosbaugh DW,锡箔农协
蛋白质模仿uracil-DNA DNA晶体结构的蛋白质糖基化酶抑制剂及其与大肠杆菌uracil-DNA复杂的糖基化酶。
J杂志。1999年3月26日,287(2):331 - 46所示。
- PubMed ID
-
10080896 (在PubMed]
- 文摘
-
Uracil-DNA糖基化酶(UDG),这是一个关键酶DNA base-excision修复从DNA识别和去除尿嘧啶,专门和irreversably抑制热稳定的Uracil-DNA蛋白质糖基化酶抑制剂(Ugi)。非常具体的悖论Ugi抑制UDG Ugi如何成功地模拟DNA骨干交互UDG没有导致与许多其他DNA酶具有显著的大支柱绑定关联。Ugi自由和高分辨率x射线晶体结构在复杂与野生型和功能缺陷His187Asp突变大肠杆菌UDGs揭示了双螺旋DNA的详细分子基础骨干Ugi模仿。Ugi的整体形状和电荷分布最接近b形式之间的轨迹中点的DNA和弯折的DNA中观察到UDG: DNA复合物的产品。因此,Ugi目标的机制尿嘧啶UDG翻转,似乎是一个过渡态模拟UDG-flipping尿嘧啶核苷酸的DNA。基本上所有的精致的形状、静电和疏水相互作用的高亲和性UDG-Ugi是预先存在的互补性,除了一个关键的翻转Ugi Gln19羰基和Glu20侧链,这是引发了复杂的形成。构象变化之间的Ugi和Ugi包裹着UDG涉及beta-zipper结构性主题,我们命名的可逆的分子内beta-strands之间的配对观察。中观察到的类似beta-zipper UDG的开放和封闭形式之间的转换。的组合非常高水平的预先存在的结构性互补DNA结合特性针对UDG Ugi解决UDG-Ugi悖论的关键地方构象变化和显示一个潜在的结构性解决方案非常高亲和力DNA酶抑制剂复合物的形成,避免交叉反应性。