晶体结构的链霉菌属olivaceoviridis e - 86 beta-xylanase包含xylan-binding域。
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藤本Z, Kuno,金子,吉田年代,小林H, Kusakabe我,美津浓H
晶体结构的链霉菌属olivaceoviridis e - 86 beta-xylanase包含xylan-binding域。
J杂志。2000年7月14日,300 (3):575 - 85。
- PubMed ID
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10884353 (在PubMed]
- 文摘
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木聚糖酶水解beta 1, 4-glycosidic债券中的木聚糖骨干,属于家庭10或11的糖苷水解酶,根据氨基酸序列相似性的催化域。一般来说,木聚糖酶催化域有一个核心,一个N和/或c端substrate-binding域和一个链接器区域。直到现在,x射线结构分析家庭10只报告了木聚糖酶的催化域和不含substrate-binding域。我们已经决定了一个家庭10木聚糖酶的晶体结构包含xylan-binding域(XBD)从链霉菌属olivaceoviridis e - 86 1.9一项决议。催化域包含一个(β/α)(8)桶拓扑与其他家庭10木聚糖酶。XBD有三个相似子域,建议从triple-repeat序列,是组装一pseudo-3-fold轴,形成类似于蓖麻毒素的galactose-binding凝集素褶皱B-chain。g / Pro-rich链接器区域连接催化域和XBD不可见的电子密度图,可能因为它的灵活性。两个域的接口在水晶是亲水的,五个直接氢键和water-mediated氢键存在。sugar-binding残留在蓖麻毒素/乳糖复杂空间守恒的XBD中三个子域,这表明所有的子域在XBD结合糖的能力。灵活的链接器区域允许两个域独立活动,可能提供一个三重底物捕捉和催化的机会。 The structure reported here represents an example where the metabolic enzyme uses a ricin-type lectin motif for capturing the insoluble substrate and promoting catalysis.