糖复合物的晶体结构,链霉菌属olivaceoviridis e - 86木聚糖酶:糖绑定家庭13碳水化合物结合的结构模块。
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藤本Z, Kuno,金子,小林H, Kusakabe我,美津浓H
糖复合物的晶体结构,链霉菌属olivaceoviridis e - 86木聚糖酶:糖绑定家庭13碳水化合物结合的结构模块。
J杂志。2002年2月8日,316 (1):65 - 78。
- PubMed ID
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11829503 (在PubMed]
- 文摘
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家庭10木聚糖酶从链霉菌属olivaceoviridis e - 86包含一个(β/α)(8)桶作为催化领域,一个家庭13碳水化合物绑定模块(CBM)作为木聚糖绑定域(XBD)和g / Pro-rich链接器。这种酶的晶体结构表明,XBD有三个类似的子域,作为triple-repeated序列表示的存在,形成半乳糖结合凝集素褶皱在蓖麻毒蛋白毒素B-chain类似发现。与蓖麻毒素/乳糖复杂的结构提出了三个潜在的XBD糖结合位点。为了了解XBD木聚糖链结合,我们分析了sugar-complex结构使用xylooligosaccharides浸泡实验方法和其他糖。在催化裂,绑定糖观察xylobiose和xylotriose复杂的结构。XBD,绑定糖被确定在子域α和γ和木糖在所有的复合物,xylobiose xylotriose、葡萄糖、半乳糖和乳糖。XBD结合木糖或xylooligosaccharides一样的糖结合位点的蓖麻毒素/乳糖复杂但其绑定的方式对木糖和xylooligosaccharides不同于半乳糖绑定模式在蓖麻毒素,即使XBD结合半乳糖以同样的方式在蓖麻毒素/半乳糖复杂。这些不同的绑定模式是利用高效、不同绑定长衬底木聚糖酶和ricin-type凝集素。XBD可以绑定任何木糖在木聚糖的支柱,而ricin-type半乳糖凝集素识别终端三明治大糖链,即使两个域家庭13 CBM结构相同。家庭13 CBM,而宽松的和广泛的使用糖特异性和某些蛋白质绑定目标糖。 In such enzyme, XBD binds xylan, and the catalytic domain may assume a flexible position with respect to the XBD/xylan complex, inasmuch as the linker region is unstructured.