晶体的快照整个反应周期保留木聚糖酶从链霉菌属olivaceoviridis e - 86。
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铃木R,藤本Z, Ito年代,Kawahara年代,金子,Taira K,长谷川T, Kuno
晶体的快照整个反应周期保留木聚糖酶从链霉菌属olivaceoviridis e - 86。
2009年7月,146 (1):61 - 70。doi: 10.1093 / jb / mvp047。Epub 2009年3月11日。
- PubMed ID
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19279191 (在PubMed]
- 文摘
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保留糖基水解酶,它催化糖基化和deglycosylation以协同的方式,是最丰富的水解酶。到目前为止,他们的可视化往往集中在糖基化,因为糖基化反应可以通过灭活deglycosylation可视化步骤和/或利用底物类似物隔离共价中间体。此外,在结构分析糖基化水解酶水解反应产品的传统浸泡法、旋光改变异头碳的反应产物迅速当然发生。这不良的结构性改变阻碍了可视化的第二步反应。在这里,我们研究了x射线晶体可视化作为一个可能的方法来可视化保留木聚糖酶的构象行程从链霉菌属olivaceoviridis e - 86。明确定义在deglycosylation异头碳的立体化学步骤,外来亲核试剂,如叠氮化,采用替代缺失的基催化剂在一个适当的突变。x射线晶体组件的可视化提供了快照整个反应,包括E * S复杂,共价中间,中间崩溃和enzyme-product (E * P)复杂。