晶体结构的一个家庭4 uracil-DNA糖基化酶从栖热菌属酸奶HB8。
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Hoseki J, Okamoto Masui R,柴田T,井上Y, Yokoyama年代,Kuramitsu年代
晶体结构的一个家庭4 uracil-DNA糖基化酶从栖热菌属酸奶HB8。
J杂志。2003年10月24日,333(3):515 - 26所示。
- PubMed ID
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14556741 (在PubMed]
- 文摘
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Uracil-DNA糖基化酶(UDG;EC 3.2.2.)删除从DNA启动DNA碱基切除修复尿嘧啶。因为水解胞嘧啶脱氨基作用的尿嘧啶是一种最常见的所有细胞能损伤dna的事件,UDG是一个重要的酶对维持基因组的完整性信息。第一次,我们报告一个家庭的晶体结构4 UDG栖热菌属酸奶HB8 (TthUDG)与尿嘧啶,解决了在1.5埃分辨率。在其他家庭中,而不是UDG酶TthUDG集群具有[4 fe-4s]。这iron-sulfur集群,这是遥远的从活性部位,与循环结构,被认为是不重要的活动但稳定的循环结构的必要条件。除了iron-sulfur集群,salt-bridges在分子和离子对表面和脯氨酸在循环的存在,被认为是导致酶的热稳定性。尽管非常低水平的序列的身份与大肠杆菌与人类UDGs(家庭1)和E。杆菌G: T / U mismatch-specific DNA糖基化酶(杯)(家庭2),二级结构的拓扑结构和秩序TthUDG类似于这些遥远的亲戚。此外,核心结构的坐标由beta-strands几乎是相同的。 Positive charge is distributed over the active-site groove, where TthUDG would bind DNA strands, as do UDG enzymes in other families. TthUDG recognizes uracil specifically in the same manner as does human UDG (family 1), rather than guanine in the complementary strand DNA, as does E.coli MUG (family 2). These results suggest that the mechanism by which family 4 UDGs remove uracils from DNA is similar to that of family 1 enzymes.