晶体结构的一种新型恶性疟原虫1-Cys酶类。
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菲舍尔Sarma GN、镍C, Rahlfs年代,M,贝克尔K, Karplus PA
晶体结构的一种新型恶性疟原虫1-Cys酶类。
J杂志。2005年3月4日,346 (4):1021 - 34。Epub 2005年1月8日。
- PubMed ID
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15701514 (在PubMed]
- 文摘
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恶性疟原虫疟疾的病原体,对氧化应激敏感,因此抗氧化酶的家庭,(插件可以)代表一个抗氧化蛋白抗疟药物设计的目标。我们这里现在1.8分辨率晶体结构的P。恶性疟原虫抗氧化蛋白,PfAOP,插件可以在哺乳动物PrxV序列组。结构相比,所有11个结构已知的插件可以获得最大洞察它的属性。我们描述了常见的插件可以折叠和显示二聚的PfAOP 1-Cys插件可以从力学上看可以分为。在活性位点peroxidatic半胱氨酸over-oxidized半胱氨酸磺酸,使这种结构的第一个插件可以看到那种状态。现在结构的插件可以在Cys-sulfenic, -sulfinic和磺酸酸氧化态,过氧化结构所涉及的步骤绑定和over-oxidation建议。我们还描述,PfAOP alpha-aneurism(一个残留插入),一个功能出现PrxV-like组的特征。晶体的方法而言,我们增强模型的信息内容通过识别结合水网站基于电子密度峰值,我们用这个信息来推断氧化活性部位有可能影响催化的次优的交互。PfAOP代表的二聚接口插件可以之间普遍存在的一个接口,并顺序相依在几何变化。 The interface differences and the structural features (like the alpha-aneurism) may be used as markers to better classify Prxs and study their evolution.