的精制1.7 x射线结构周质的葡萄糖/半乳糖受体鼠伤寒沙门氏菌。
文章的细节
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引用
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邹司法院,Flocco MM,莫布雷SL
的精制1.7 x射线结构周质的葡萄糖/半乳糖受体鼠伤寒沙门氏菌。
J杂志。1993年10月20日,233 (4):739 - 52。
- PubMed ID
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8240551 (在PubMed]
- 文摘
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的x射线结构周质的葡萄糖/半乳糖受体(结合蛋白)的鼠伤寒沙门氏菌(GBP-S)精制分辨率1.7 r因子的19.0%。模型包含所有309个残基的氨基酸序列,153年,钙离子和水分子beta-D-galactose。蛋白质由两个非常相似的结构域组成,每一个都是由一个核心的平行β褶板两侧有阿尔法螺旋。三个短的氨基酸链(从对称结构)的相关部分连接域,并假定作为铰链允许他们的相对运动功能重要的构象变化。半乳糖绑定域之间的相互作用与侧链的循环衬里绑定间隙。氢键、疏水和立体效果产生紧密的绑定(离解常数0.2 microM)和高特异性。九氢键组,三天冬氨酸,三天冬酰胺,一个组氨酸(unprotonated)、精氨酸和水,贡献13氢键。针对(主要)的额外残留包非极性的糖分子。的精确排列氢键和疏水残基的结果在一个封闭的形状是一个复合的结合位点的糖分子。据推测,配体受体的绑定到一个更加开放的形式,然后关闭旋转的铰链。 Comparison with the GBP-S structure solved earlier in complex with glucose shows no significant changes, even for the aspartate residue most directly involved with the different sugars. Comparison with the galactose/glucose receptor of Escherichia coli indicates that these two proteins are very similar in overall structure, with the main difference being a 2 to 3 degrees rotation in the hinge. This difference appears to be the result of different crystal packing for the two proteins; it is likely that both conformations are normally found in solution.