生化和结构的研究N5-carboxyaminoimidazole核苷酸变位酶的嗜酸性细菌醋酸杆菌。
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康斯坦丁CZ,斯塔克斯厘米,密尔CP, Ransome AE, Karpowicz SJ,弗朗索瓦•是的,古德曼RA, Kappock TJ
生化和结构的研究N5-carboxyaminoimidazole核苷酸变位酶的嗜酸性细菌醋酸杆菌。
生物化学。2006年7月11日,45 (27):8193 - 208。
- PubMed ID
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16819818 (在PubMed]
- 文摘
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N5-carboxyaminoimidazole核苷酸(N5-CAIR)变位酶(纯)催化N5-CAIR acid-labile化合物可逆互变现象和4-carboxy-5-aminoimidazole核苷酸(以下简称规则)。我们已经检查了嗜酸菌的纯醋酸杆菌(AaPurE),关注其适应酸性pH值和守恒的残留物His59和His89的角色。AaPurE和大肠杆菌纯显示quasi-reversible acid-mediated失活,但wt AaPurE更稳定在pH值为3.5,与>或= 20摄氏度温度更高的热展开小灵通。His89并不重要,不作为一个质子继电器系统的一部分。kcat的ph值配置文件是一致的分配pK1徒劳的质子化作用结合核苷酸和pK2 His59去质子化。1.85分辨率晶体结构的不突变H59N-AaPurE浸泡在以下简称表明,以下简称C4的质子化作用可以发生在His59的缺失。由此产生的物种,建模为isoCAIR [4 (R) -carboxy-5-iminoimidazoline核苷酸),是强烈稳定广泛的酶和水分子的相互作用。羧酸盐的一部分被放置在一个小口袋提出促进核苷酸脱羧前进方向(N5-CAIR - - >以下简称)[Meyer, E。Kappock, t·J。Osuji C。诊疗,j .(1999)生物化学38,3012 - 3018]。比较模型的研究表明,在相反的方向(nonbiosynthetic)纯支持以下简称C4的质子化作用。 We suggest that the essential role of protonated His59 is to lower the barrier to decarboxylation by stabilizing a CO2-azaenolate intermediate.