系统发育深度S10和spc操纵子:核糖体蛋白基因的克隆和测序集群的极端嗜热细菌Thermotoga maritima。
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Sanangelantoni, Bocchetta M,卡马拉P, Tiboni O
系统发育深度S10和spc操纵子:核糖体蛋白基因的克隆和测序集群的极端嗜热细菌Thermotoga maritima。
J Bacteriol。1994年12月,176 (24):7703 - 10。
- PubMed ID
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8002596 (在PubMed]
- 文摘
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一段Thermotoga maritima DNA跨越6613个基点的下游基因tuf延长因子图被使用染色体测序行走策略。测序地区组成一串14紧密联系开放阅读框(orf)开始从tuf下游50个基点。第一批11个orf确认为核糖体蛋白基因的同源染色体rps10, rpl3, rpl4, rpl23, rpl2, rps19, rpl22, rps3, rpl16, rpl29,和rps17(在大肠杆菌组成S10操纵子,这个顺序);最后三个orf同源基因rpl14 rpl24, rpl5(在大肠杆菌构成三个promoter-proximal壮观霉素的基因操纵子)。14-gene字符串之前是公认的-35年和-10年启动子序列位于5 '在50个基点基因rps10间距基因tuf rps10;同一地区表现出潜在的转录终止信号的上游基因簇(tuf最后基因)也显示潜在的形成一个发夹循环阻碍终结者;这表明rps10和下游基因的转录可能开始往上游。类似组织deepest-branching rp基因测序的细菌类群(t . maritima)和古生菌已经被解释为表明S10-spc基因排列存在于(去年)共同的祖先。Thermotoga血统的系统发育深度探索了使用r蛋白标记分子:在所有除了一个案例(S3),变形菌门或革兰氏阳性细菌,而不是属Thermotoga是deepest-branching血统;只有两种情况下,然而,被引导分析推断分支顺序证实。