es purine-specific核苷水解酶从锥虫属间日疟原虫的交互。
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诗W, Decanniere K, Van Holsbeke E, Devroede N, Steyaert J
es purine-specific核苷水解酶从锥虫属间日疟原虫的交互。
生物化学杂志。2002年5月3日;277(18):15938 - 46所示。Epub 2002年2月19日。
- PubMed ID
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11854281 (在PubMed]
- 文摘
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嘌呤核苷水解酶是关键酶的救助途径锥虫科和被认为是药物设计的目标。我们之前报道的第x射线结构inosine-adenosine-guanosine喜欢核苷水解酶(IAG-NH)锥虫属间日疟原虫()。这里我们报告2.0——慢D10A突变体的晶体结构复杂和抑制剂3-deaza-adenosine 1.6——晶体结构相同的酶与真正的衬底肌苷复杂。es复杂显示了衬底绑定到酶在不同的构象3-deaza-adenosine和提供了一个快照以及酶催化反应的反应坐标。化学组绑定和催化的底物重要的映射。2 ' -哦,3 ' -哦,5 ' -哦贡献4.6,7.5,和5.4千卡/摩尔k (cat) / k (m),分别。具体与嘌呤环上的环外的组织相互作用是催化不是必需的。定点诱变表明嘌呤IAG-NHs的特异性是由一个平行的芳香堆积相互作用涉及Trp(83)和Trp (260)。pH值的k(猫)和k (cat) / k (m)表示一个或多个质子捐助者的存在,可能参与离去基团活化。然而,诱变活性位点残基的核苷基地和一个灵活的丙氨酸扫描循环活性部位附近无法识别这个一般酸。 The parallel aromatic stacking seems to provide the most likely alternative mechanism for leaving group activation.