L1金属-β-内酰胺酶的晶体结构从Stenotrophomonas maltophilia 1.7一项决议。
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Ullah JH,沃尔什TR,泰勒IA,金刚砂,胆量CS, Gamblin SJ,斯宾塞·J
L1金属-β-内酰胺酶的晶体结构从Stenotrophomonas maltophilia 1.7一项决议。
J杂志。1998年11月20日,284 (1):125 - 36。
- PubMed ID
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9811546 (在PubMed]
- 文摘
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L1金属-β-内酰胺酶的结构从机会病原体Stenotrophomonas maltophilia 1.7分辨率决定了多波长反常色散(疯狂)方法利用内在中心双核的锌和硒代蛋氨酸残留。L1是独特的在所有已知beta-lactamases四聚物,它的存在。蛋白质展品alphabeta / betaalpha褶皱发现只有在金属-β-内酰胺酶并显示一些独特的功能而不是以前观察到这些酶。这些包括二硫化物桥和两个大大延长循环与酶的活性部位。绑定两个紧密间隔的锌离子在活性位点四面体(Zn1)和三角双锥体(Zn2)协调,分别;这些由水分子弥合我们建议作为亲核试剂的水解反应。结扎第二锌离子涉及残留物和几何以前没有观察到金属-β-内酰胺酶。模拟结合底物氨苄青霉素、头孢他啶和imipenem表明酶的底物能够绑定到各种不同的构象,其共同的特征的直接交互beta-lactam羰基氧和氮的锌离子和beta-lactam Ser187羧酸盐。我们描述一个催化机理,它们的主要功能是桥接水的亲核攻击beta-lactam羰基碳,静电稳定的带负电荷的四面体的过渡态和质子化作用beta-lactam氮通过第二个水分子协同Zn2。进一步,我们提议直接金属:衬底相互作用提供了一个重大贡献衬底绑定,这也许可以解释缺乏特异性,这类酶的特性。