解决方案R6人类胰岛素六聚物的结构。
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张X,约根森,Bardrum P, JJ
解决方案R6人类胰岛素六聚物的结构。
生物化学。1997年8月5日,36(31):9409 - 22所示。
- PubMed ID
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9235985 (在PubMed]
- 文摘
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的三维解决方案结构phenol-stabilized 36 kDa R6胰岛素六聚体是由核磁共振光谱和克制的分子动力学。六聚物结构推导出使用一个逐步的过程。最初,60单体通过距离几何从665年NOE-derived距离限制和三个二硫桥。随后,六聚体结构的计算是通过模拟退火,使用30五个一由最好的36个单体结构的模型开始。NMR数据表明,残留的芳环板式换热器(B25)解决方案六聚物可以采取两种不同的取向:一个在它内点(分子1,约90%),另一个在它从表面向外分的单体(分子2,约10%)。beplayapp因此,两个六聚物结构计算:对称六聚物组成的六个分子1单体和非对称六聚物组成的五个分子1单体和一个分子2单体。为每个六个单体,六聚体结构的计算中使用的限制包括,除了intramonomeric限制,25之间不胰岛素和苯酚,23不跨二聚体界面和两个氢键,九不穿过三聚物界面,和五个intramonomeric或两个intermonomeric不,分别指定不同方向的板式换热器(B25)戒指。协调两个锌原子是由八个距离限制。因此,4394年和4391年的总距离限制,分别是用于两个六聚体的计算。一个限制是归类在一个迭代过程内部的基础上——或者intermonomeric与单体的结构一致性或不一致。 The assignment of the dimer- and trimer-specific NOEs was made using the crystal structure of the R6 hexamer as the starting model. For both solution hexamers, the average backbone rms deviation is 0.81 A, if the less well-defined N- and C-terminal residues are excluded. The corresponding rms deviations for all heavy atoms are 1.17 and 1.19 A for the nonsymmetric and symmetric hexamer, respectively. The overall solution structure of the R6 insulin hexamer is compact, rigid, and symmetric and resembles the corresponding crystal structure. However, the extension of the B-chain alpha-helix, which characterizes the R state, is shorter in the solution structure than in the crystal structure. Also, the study shows that the orientation of the Phe(B25) ring has no effect on the structure of the rest of the molecule, within the uncertainty of the structure determination. The importance of these findings for the current model for the insulin-receptor interaction is discussed.