裂解位点特异性prolyl肽链内切酶FAP调查与全身蛋白质基质。
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黄CH,孙CS,林CT,简CH,李重,钟公里,蔡泰,Jiaang WT,黄MJ,陈X
裂解位点特异性prolyl肽链内切酶FAP调查与全身蛋白质基质。
,2011年6月,149 (6):685 - 92。doi: 10.1093 / jb / mvr017。Epub 2011 2月1。
- PubMed ID
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21288888 (在PubMed]
- 文摘
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成纤维细胞激活蛋白(FAP)是一个prolyl-cleaving肽链内切酶提出作为抗癌药物的目标。有必要定义其裂解位点特异性促进体内基质的识别和理解它的生物功能。我们发现之前确定基质FAP,α(2)-anti-plasmin,不是一个健壮的底物在体外。SPRY2,相反,一种细胞内蛋白质可分裂的FAP和更适合的底物特异性背景调查的完整的球状蛋白。FAP喜欢卸货残留,包括小或笨重的疏水氨基酸,但不带电氨基酸,特别是酸性渣在P1, P3和P4网站。分子模拟分析表明,substrate-binding FAP的周围是多个酪氨酸残基和一些带负电荷的残留物,这可能产生至少偏爱基质酸性残基。这提供了一个解释为什么FAP不能粘住白细胞介素,有谷氨酸在P4或P2”,尽管他们SPRY2或alpha-AP P3-P2-P1地点相同。我们的研究提供了新的信息FAP裂解位点特异性,这不同于通过分析肽库获得的数据或变性蛋白,明胶,作为衬底。此外,我们的研究表明,带负电荷的残留物应避免在设计FAP抑制剂。