拓扑扫描和假定的三维结构的细胞外绑定域名顶端sodium-dependent胆汁酸转运体(SLC10A2)。
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张唱片菲尔普斯马,Banerjee Khantwal厘米,Chang C、F的负责人,Swaan PW
拓扑扫描和假定的三维结构的细胞外绑定域名顶端sodium-dependent胆汁酸转运体(SLC10A2)。
生物化学。2004年9月14日,43 (36):11380 - 92。
- PubMed ID
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15350125 (在PubMed]
- 文摘
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顶端sodium-dependent胆汁酸转运体(ASBT SLC10A2)促进胆汁的肝肠循环盐和胆固醇代谢中发挥着关键作用。ASBT最初的膜拓扑扫描使用共识地形分析主要预测七个跨膜域配置(TM)坚持积极的内部规则。膜结构被N-glycosylation-scanning诱变进一步评估和确认,作为假定的记者网站插入细胞外循环1和3是糖化。7 tm拓扑的基础上,我们构建了一个三维模型的ASBT homology-modeling和remote-threading技术的使用方法extramembranous域使用细菌视紫红质作为膜支架附件点;使用能量最小化模型精炼和分子动力学模拟。拉马钱德兰分数和其他几何指标表明,模型质量相当类似的蛋白质的晶体结构。模拟退火和胆酸的对接,自然基质,在蛋白质表面显示四个不同的结合位点。随后的定点诱变域进一步验证模型预测的绑定。该模型进一步同意与可用数据病理变异(P290S)因为突变模型在硅片诱变后失去了胆汁酸结合的能力。