假单胞菌的克隆的基因参与咔唑降解sp.应变CA10:基因的核苷酸序列和表征meta-cleavage酶和水解酶。
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佐藤SI, Ouchiyama N,木村T, Nojiri H, Yamane H, Omori T
假单胞菌的克隆的基因参与咔唑降解sp.应变CA10:基因的核苷酸序列和表征meta-cleavage酶和水解酶。
J Bacteriol。1997年8月,179 (15):4841 - 9。
- PubMed ID
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9244273 (在PubMed]
- 文摘
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DNA片段编码meta-cleavage酶和meta-cleavage复合水解酶,参与咔唑降解,从carbazole-utilizing克隆菌假单胞菌CA10 sp.压力。DNA序列分析2.6 kb SmaI-SphI片段显示,有三个开放阅读框(ORF2 ORF1, ORF3,这个基因顺序)。ORF1和ORF2不可或缺的meta-cleavage活动2》-aminobiphenyl-2 3-diol及其容易模拟2,3-dihydroxybiphenyl,并指定carBa carBb,分别。的一致性与其他meta-cleavage CarBb酶表明CarBb可能有非亚铁血红素辅因子协调网站。系统发育树的基础上,CarBb列为protocatechuate成员4,5-dioxygenase家庭。碳水化合物,这种独特的extradiol加双氧酶显著高亲和力和高20倍meta-cleavage活动2,3-dihydroxybiphenyl比苯邻二酚衍生品beplayapp。假定的多肽由ORF3编码是同源meta-cleavage化合物水解酶在其他细菌,并指定carC ORF3。的水解酶活动CarC 2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2, 4-dienoic酸,meta-cleavage化合物2,3-dihydroxybiphenyl, 40倍,2-hydroxy-6-oxohepta-2 4-dienoic酸,3-methylcatechol meta-cleavage化合物。一致性分析和系统发育树显示CarC最大的同源性和水解酶参与单芳化合物的降解途径。这些结果表明CarC的可能性是一种小说类型的水解酶。