完整的核苷酸序列的咔唑/ dioxin-degrading在假单胞菌质粒pCAR1 resinovorans应变CA10表明mosaicity和大型异化的转座子Tn4676的存在。
文章的细节
-
引用
复制到剪贴板 -
Maeda K, Nojiri H, Shintani M,吉田T,有H, Omori T
完整的核苷酸序列的咔唑/ dioxin-degrading在假单胞菌质粒pCAR1 resinovorans应变CA10表明mosaicity和大型异化的转座子Tn4676的存在。
J杂志。2003年2月7日,326 (1):21-33。
- PubMed ID
-
12547188 (在PubMed]
- 文摘
-
汽车和ant操纵子最初从假单胞菌分离resinovorans应变CA10包含咔唑/ dioxin-degrading基因编码酶和邻氨基苯甲酸盐1,2-dioxygenase,分别位于质粒pCAR1。整个核苷酸序列pCAR1决心阐明汽车操纵子的机制可能是组装和分布在自然。pCAR1 199035 - bp环状质粒,携带190开放阅读框架。虽然不相容组pCAR1尚不清楚,但其潜在来源复制,OriP,代表和Par蛋白似乎是密切相关的质粒pL6.5隔绝的荧光假单胞菌。潜在tellurite-resistance klaABC repA基因的基因识别邻近地区也与那些IncP从假单胞菌质粒最初确认。另一方面,我们发现基因编码蛋白质显示低但显著的同源性(20 - 45%的身份)皇室从肠杆菌科和运输蛋白,可能涉及的接合转移质粒或基因组岛,这表明pCAR1也是一个接合质粒。在pCAR1,我们发现tnpAcCST基因编码的蛋白质显示> 70% length-wise身份与编码由甲苯/ xylene-degrading转座子Tn4651 TOL质粒pWW0。汽车和蚂蚁都趋向下降的操纵子被发现在72.8 kb Tn4676序列定义为侧翼tnpAcC tnpST基因和接壤46-bp反向重复(IR)。Tn4676及其侧翼地区内,我们发现大量的残余移动遗传元素,如复制转座酶基因高度同源tnpR Tn4653和国税局的多个候选人Tn4676和Tn4653-like元素。我们还发现不同地区在Tn4676 G + C含量高低,分别含有一个ant操纵子和汽车操纵子。 These results suggested that multiple step assembly could have taken place before the current structure of Tn4676 had been captured.