BphD抑制的分子基础,碳碳键水解酶参与多氯联苯降解:大型3-substituents防止互变异构化。
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Bhowmik年代,Horsman GP,柏林JT, Eltis LD
BphD抑制的分子基础,碳碳键水解酶参与多氯联苯降解:大型3-substituents防止互变异构化。
生物化学杂志。2007年12月14日,282 (50):36377 - 85。Epub 2007年10月11日。
- PubMed ID
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17932031 (在PubMed]
- 文摘
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的微生物降解多氯联苯(pcb)联苯分解(Bph)途径是有限的途径的第四部分的酶,BphD。2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2 BphD催化一种不同寻常的碳碳键水解,4-dienoic酸(HOPDA),底物受到histidine-mediated enol-keto互变异构化水解前。氯化HOPDAs如3-Cl HOPDA抑制BphD。这里我们报告BphD优先水解一系列3-substituted HOPDAs H F > > Cl >我的顺序,说明催化影响空间,不是电子,决定因素。瞬态动力学研究使用野生型BphD执行和hydrolysis-defective S112A变异表明,大型3-substituents抑制他的- 265催化互变异构化5个数量级。S112A的结构分析。3-Cl HOPDA S112A。3,10-diF HOPDA复合物显示非生产性绑定模式中定义的平面碳原子的dienoate一半的HOPDA几乎是正交的提议酮互变异构体S112A观察。HOPDA复杂。此外,在3-Cl HOPDA复杂,3.6 2-hydroxo集团是感动的位置附近的催化与参数- 190 - 265氢键和访问他的- 265被3-Cl取代基。非生产性的绑定可以稳定交互涉及3-substituent与非极性侧链。溶剂分子穷人获得S112A C6。3-Cl HOPDA structure, more consistent with hydrolysis occurring via an acyl-enzyme than a gem-diol intermediate. These results provide insight into engineering BphD for PCB degradation.