shape-based 3 d支架跳跃方法及其应用细菌蛋白质的相互作用。
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TS第三,格兰特JA, Mosyak L,尼科尔斯
shape-based 3 d支架跳跃方法及其应用细菌蛋白质的相互作用。
J地中海化学。2005年3月10日,48 (5):1489 - 95。
- PubMed ID
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15743191 (在PubMed]
- 文摘
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在本文中,我们描述的第一个潜在应用shape-comparison程序roc(化学结构的快速覆盖)寻找新的支架的小分子抑制剂ZipA-FtsZ蛋白质相互作用,提出了抗菌的目标。形状比较是相对于结晶学,生物活性构象的大规模筛选(高温超导)。中华民国的使用导致了识别一系列小说,与支架呈现弱结合抑制剂合成机会进一步优化生物亲和性和缺乏发展问题与高温超导领先。这些ROCS-identified支架会错过使用伊希斯等其他结构相似性方法2 d指纹。x射线晶体分析的一个新的抑制剂会安然表明,形状比较方法非常准确地预测绑定模式。这些实验结果验证使用roc chemotype转换或“跳跃”,表明它在药物发现先导化合物的一般利益的努力。