Acidithiobacillus ferrooxidans新陈代谢:从基因组序列到工业应用。
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巴尔德斯J, Pedroso我Quatrini R,道森RJ, Tettelin H,布莱克R 2日艾森是的,福尔摩斯DS
Acidithiobacillus ferrooxidans新陈代谢:从基因组序列到工业应用。
BMC基因组学。2008年12月11日,9:597。doi: 10.1186 / 1471-2164-9-597。
- PubMed ID
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19077236 (在PubMed]
- 文摘
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背景:Acidithiobacillus ferrooxidans微生物的主要参与联盟用于工业复苏的铜(bioleaching或biomining)。chemolithoautrophic, gamma-proteobacterium使用能源从铁的氧化,为经济增长和含硫矿物。它能在极低的pH值(pH值1 - 2)和修复都从大气中碳和氮。从岩石和溶解铜和其他金属中扮演一个重要的角色在营养和金属在酸环境中生物地球化学循环。缺乏成熟的基因操纵系统阻止了生理学的深入探索。混乱也已经由之前的代谢模型构建基于多的考试,有时远亲,微生物菌株。结果:a型菌株的基因组ferrooxidans写明ATCC 23270测序和注释识别一般特征和在硅片代谢重建提供了一个框架。早些时候的铁和硫氧化模型,生物膜的形成,群体感应,无机离子的吸收,和氨基酸代谢是确认和扩展。初始模型提出了中心碳代谢,厌氧代谢(包括减少硫、氢代谢和氮固定),应激反应、DNA修复、金属和有毒化合物通量。结论:生物信息学分析功能基因的发现和预测提供了一个宝贵的平台,有助于解释的活动a ferrooxidans工业bioleaching和它作为初级生产者的角色在酸性环境中。 An analysis of the genome of the type strain provides a coherent view of its gene content and metabolic potential.