的晶体结构和共振拉曼研究protocatechuate 3 4-dihydroxyphenylacetate 4-dioxygenase包裹着。
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Elgren TE,奥维尔,凯利KA,以至于JD,黑轮DH, L
的晶体结构和共振拉曼研究protocatechuate 3 4-dihydroxyphenylacetate 4-dioxygenase包裹着。
生物化学。1997年9月23日,36(38):11504 - 13所示。
- PubMed ID
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9298971 (在PubMed]
- 文摘
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厌氧的晶体结构复杂的假单胞菌putida protocatechuate 3 4-dioxygenase (3 4-PCD)绑定替代基质,3,4-dihydroxyphenylacetate (HPCA),据报道在分辨率和精制2.4 R因子为0.17。形成的活性部位铁(III)。HPCA螯合复杂导致内源性轴tyrosinate Tyr447 (147 beta),使分离铁和旋转到另一个方向类似于先前观察到的厌氧3 4-PCD。3,4-dihydroxybenzoate复杂(3 4-PCD.PCA)[奥维尔,a . M。以至于,j . D。&黑轮,d·h·36(1997)生物化学,10052 - 10066]。两个芳环的方向HPCA近似相关的180度旋转内电子密度的活性部位是一致的。共振拉曼光谱(rR)数据从Brevibacteriumfuscum 3 4-PCD。HPCA复杂解决方案显示低频rR振动乐队在500年和650年之间cm - 1以及一个乐队大约在1320 cm - 1 HPCA的诊断。铁(III)螯合物。18 o标记的HPCA C4或C3羟基明确建立振动耦合模式与五元螯合环系统相关。这些数据的分析结果表明,铁(III) -HPCAO4债券比铁(III)短-HPCAO3债券。 This consequently favors the model for the crystal structure in which the C3 phenolic function occupies the Fe3+ ligand site opposite the endogenous ligand Tyr408(Oeta) (108beta). This is essentially the same binding orientation as proposed for PCA in the crystal structure of the anaerobic 3,4-PCD.PCA complex based solely on direct modeling of the 2Fo - Fc electron density and suggests that this is the conformation required for catalysis.