长链n -氨基酸合成酶与假定的PEP-CTERM / exosortase protein-sorting系统革兰氏阴性细菌。
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克雷格•JW樱桃马,布雷迪科幻
长链n -氨基酸合成酶与假定的PEP-CTERM / exosortase protein-sorting系统革兰氏阴性细菌。
J Bacteriol。2011年10月,193(20):5707 - 15所示。doi: 10.1128 / JB.05426-11。Epub 2011年8月12日。
- PubMed ID
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21840974 (在PubMed]
- 文摘
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克隆编码长链n -氨基酸的生物合成是经常从基于活动的屏幕的土壤宏基因组库中恢复过来。的成员不同的一组酶称为n -氨基酸合成酶负责所有metagenome-derived n -氨基酸的生产特点。基于n -氨基酸的频率从宏基因组样本合酶基因已经被鉴定,相关基因在全球普遍预计将细菌metagenome。同系物的metagenome-derived n -氨基酸合酶基因是稀缺的,然而,在培养细菌的基因组测序的物种。对目标的理解所扮演的角色(s) n -氨基酸在环境细菌,我们寻找定位守恒的遗传特性与metagenome-derived n -氨基酸合酶基因。这一分析显示,n -氨基酸合酶基因经常发现相邻基因预测编码PEP-CTERM motif-containing蛋白质和,在某些情况下,其他保存元素的PEP-CTERM / exosortase系统。尽管相对很少有人知道PEP-CTERM / exosortase系统,其beplayapp核心部件被认为代表了假定的革兰氏阴性相当于LPXTG / sortase protein-sorting革兰氏阳性细菌的系统。在这次调查过程中,我们能够提供证据证明假设的酰基转移酶的无特征的家庭,此前与生物信息学PEP-CTERM / exosortase系统,是一个新的家庭的n -氨基酸合成酶PEP-CTERM / exosortase中广泛分布的系统,包含变形菌门。