结构形式的(4-hydroxyphenyl)丙酮酸亚铁加双氧酶从链霉菌属avermitilis在复杂的治疗性除草剂,NTBC。
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Brownlee JM, Johnson-Winters K,哈里森DH,莫兰GR
结构形式的(4-hydroxyphenyl)丙酮酸亚铁加双氧酶从链霉菌属avermitilis在复杂的治疗性除草剂,NTBC。
生物化学。2004年6月1日,43 (21):6370 - 7。
- PubMed ID
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15157070 (在PubMed]
- 文摘
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Di -三酮(4-hydroxyphenyl)丙酮酸加双氧酶抑制剂(HPPD)都是有效的除草剂和疗法。抑制活动是用来停止生产的亲脂性的氧化还原辅因子在植物和人类防止积累的有毒代谢所产生的副产品酪氨酸分解代谢的具体天生的缺陷。铁(II)的三维结构的形式从链霉菌属HPPD avermitilis在复杂的抑制剂2 - [2-nitro-4 - (triflouromethyl)苯甲酰)1,3-cyclohexanedione (NTBC) 2.5的决议决定。NTBC坐标活性部位金属离子,位于底部的一个宽solvent-accessible腔的c端域蛋白质。铁配位体在一个主要five-coordinate,扭曲square-pyramidal Glu349安排,His187, His270 protein-derived配体和两个其他配体5和7个氧原子的NTBC。有一个低居住水分子在第六协调网站原体之一。距离His270异常长为2.5,从理想的配体及其取向有些扭曲的几何在2.8的抑制剂硝基。与四聚物的quartenary结构观察HPPD从其他细菌来源,两个弱相关的不对称单元是由原体埋表面积为1266(2),总共12个氢键和静电相互作用。整个三级结构相似的HPPD荧光假(Serre et al .,(1999)结构7,977 - 988),尽管c端阿尔法螺旋是显著的位置发生了变化。这个c端阿尔法螺旋提供Phe364,结合Phe336三明治绑定NTBC苯基环; no other significant hydrogen-bonding or charge-pairing interactions are observed. Moreover, the structure reveals that, with the exception of Val189, NTBC makes contacts to only fully conserved amino acids. The combination of bidentate metal-ion coordination and pi-stacked aromatic rings is suggestive of a binding mode for the substrate and/or a transition state, which may be the origin of the exceedingly high affinity these inhibitors have for HPPD.