限制性内切核酸酶BpuJI特定的5 ' -CCCGT序列相关热点霍利迪结解离的家庭。
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Sukackaite R, Lagunavicius Stankevicius K, Urbanke C, Venclovas C, Siksnys V
限制性内切核酸酶BpuJI特定的5 ' -CCCGT序列相关热点霍利迪结解离的家庭。
核酸研究》2007;35 (7):2377 - 89。Epub 2007年3月28日。
- PubMed ID
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17392342 (在PubMed]
- 文摘
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类型IIS限制性内切酶(原因)认识到不对称的DNA序列和分裂DNA链在固定位置识别网站的下游。原因BpuJI认识到不对称序列5 '削减-CCCGT,然而它在多个站点附近的目标序列。我们表明,BpuJI二聚物,它有两个DNA结合表面并显示最佳的催化活性当绑定到两个识别网站。BpuJI由胰凝乳蛋白酶裂解成n端结构域(元),特别缺乏催化活性,但结合识别序列作为单体,c端域(CTD),形成一个二聚体和非特异性核酸酶的活动。折叠识别方法揭示了CTD BpuJI结构相关热点霍利迪结解离(AHJR)。我们证明,孤立的催化CTD BpuJI拥有end-directed核酸酶活性和削减优先3 nt blunt-ended 3 '末端的DNA。核酸酶活动的连续油管是酶朊压抑,成为激活特定的DNA结合后被忽略。这导致一个复杂的特定DNA模式乳沟附近的目标站点。生物信息学分析确定AHJR-like领域公认的第三类型的酶和蛋白质功能无特征。