识别领域的BpuJI限制性内切核酸酶与DNA同源为1.3 a分辨率复杂。
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Sukackaite R, Grazulis年代,Bochtler M, Siksnys V
识别领域的BpuJI限制性内切核酸酶与DNA同源为1.3 a分辨率复杂。
J杂志。2008年5月16日,378 (5):1084 - 93。doi: 10.1016 / j.jmb.2008.03.041。Epub 2008年3月28日。
- PubMed ID
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18433771 (在PubMed]
- 文摘
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类型IIS限制内切酶识别DNA序列和不对称分裂两种DNA链固定位置识别网站的下游。的限制性内切核酸酶BpuJI认识到不对称序列5 ' -CCCGT;然而,它在多个站点附近的削减目标序列。BpuJI包含两个独立的物理领域,催化和二聚作用函数的c端域在n端结构域和DNA识别功能。在这里,我们报告的晶体结构BpuJI识别域绑定到同源DNA为1.3 a分辨率。这个区域折叠成两个winged-helix子域,D1和D2, DL子域名的空间。D1和D2 BpuJI共享结构相似的子域类似FokI dna结合域的子域;然而,他们的方向protein-DNA复合物是不同的。5 ' -CCCGT目标序列的识别是通过BpuJI通过氨基酸残基的主要槽接触位于helix-turn-helix图案和氨基的手臂。这些交互作用的DNA识别也证实,突变分析。