构象转换和结构的可变形性EcoRV核酸内切酶晶体分析所揭示。
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Perona一起JJ,马丁
构象转换和结构的可变形性EcoRV核酸内切酶晶体分析所揭示。
J杂志。1997年10月17日,273(1):207 - 25所示。
- PubMed ID
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9367757 (在PubMed]
- 文摘
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野生型和突变体的结构形式的unliganded EcoRV核酸内切酶二聚体已经在2.4决议确定一个新的晶格。这些结构的比较与自由酶的构象不同包装的限制的决定表明,域之间的接口并不守恒的晶体形式。unliganded酶和enzyme-DNA复杂描绘两个截然不同的第四纪州相隔25度intersubunit旋转,但相当多的构象异构性,10度的域旋转,存在于每一个国家。比较两种晶体形式之间的自由酶结构进一步表明,c端28个氨基酸残基是无序和接受一个广泛的地方折叠在DNA结合过渡。介绍dna突变T93A的间隙导致大规模对蛋白质构象的影响。结构变化的突变unliganded酶二聚作用界面的传播一些20到25,导致单体单元的重排。这些结构的比较分析,新结构的酶与DNA和钙离子共晶,和之前确定cocrystal结构显示重要作用的氨基酸残基在促进intersubunit运动和地方折叠过渡。特别是T93A通过蛋白质结构揭示了一个通路,dna结合蛋白可能导致域运动所需的适当的对齐催化组。关键活性部位残留Glu45坐落在一个灵活的螺旋在这个通路,这提供了一个直接的手段基本催化功能耦合的蛋白质构象的变化。似乎间接通过改变微扰Glu45构象的四级结构可能是一个因素T93A的催化效率下降,这个机制也可以解释其他活性位点变异的EcoRV减少活动。