结构分析的突变热点EcoRV限制性内切核酸酶:主链羰基的催化作用。
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托马斯MP,布雷迪RL,哈尔福德,会话RB鲍德温GS
结构分析的突变热点EcoRV限制性内切核酸酶:主链羰基的催化作用。
核酸研究》1999年9月1;27 (17):3438 - 45。
- PubMed ID
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10446231 (在PubMed]
- 文摘
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随机诱变后的生态房车核酸内切酶,高比例的零Gln69突变体进行替换。这种突变体显示降低利率的DNA乳沟一步反应途径,然而,野生型的晶体结构生态房车无法解释为什么Gln69活动是至关重要的。在这项研究中,晶体结构测定两个突变体的生态房车,亮氨酸和Glu在69年残渣,绑定到特定的DNA。突变体的结构类似于本机蛋白质,没有功能可以归因于在这个位点氨基酸的侧链。相反,突变蛋白的结构表明,催化缺陷是由于主链羰基的定位。es复杂的生态房车,主链羰基Gln69没有相互作用的催化功能,但在enzyme-product复杂,它协调金属离子绑定到新解放的5 '磷酸。这可能和突变的蛋白质可能阻碍。分子动力学计算表明,在磷酰氧与金属羰基在磷酸二酯水解后形成五价的中间。因此,主链羰基可能发挥作用在催化环保房车。